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提速近10倍！基于深度学习的全基因组选择新方法来了******

　　近日，中国农业科学院作物科学研究所、三亚南繁研究院大数据智能设计育种创新团队联合多家单位提出利用植物海量多组学数据进行全基因组预测的深度学习方法, 可以实现育种大数据的高效整合与利用，将助力深度学习在全基因组选择中的应用，为智能设计育种及平台构建提供有效工具。相关研究成果发表在《分子植物（Molecular Plant）》上。

　　全基因组选择作为新一代育种技术，通过构建预测模型，根据基因组估计育种值进行早期个体的预测和选择，从而缩短育种世代间隔，加快育种进程，节约成本，推动现代育种向精准化和高效化方向发展。

　　统计模型作为全基因组选择的核心，极大地影响了全基因组预测的准确度和效率。传统预测方法基于线性回归模型，难以捕捉基因型和表型间的复杂关系。

　　相较于传统模型，非线性模型（如深度网络神经）具备分析复杂非加性效应的能力，人工智能和深度学习算法为解决大数据分析和高性能并行运算等难题提供了新的契机，深度学习算法的优化将会提高全基因组选择的预测能力。

　　该研究团队以玉米、小麦和番茄3种作物的4种不同维度的群体数据为测试材料，通过创新深度学习算法框架开发了全基因组选择新方法。

　　与其他五种主流预测方法相比，该方法有以下优点： 可以利用多组学数据开展全基因组预测；算法设计中包含批归一化层、回调函数和校正线性激活函数等结构，可以有效降低模型错误率，提高运行速度；预测精度稳健，在小型数据集上的表现与目前主流预测模型相当，在大规模数据集上预测优势更加明显；计算时间与传统方法相近，比已有深度学习方法提速近10倍；超参数调整对用户更加友好。

　　该研究得到了国家重点研发计划、国家自然科学基金、海南崖州湾种子实验室和中国农业科学院科技创新工程等项目的支持。

学术支持

中国农业科学院作物科学研究所

记者

宋雅娟

武汉东湖海洋乐园“天外来兔”闹新春******

武汉东湖海洋乐园 通讯员供图

　　楚天都市报极目新闻讯（记者韩婷 刘微通讯员刘希）兔年春节的脚步越来越近，武汉东湖海洋乐园已为广大游客准备好丰盛的春节活动，推出“天外来兔·海洋新纪元”系列活动闹新春，过年快乐不打烊。

　　武汉东湖海洋乐园负责人向极目新闻记者介绍，1月22日至1月27日，来自“宇宙护卫队”的两名“兔兔”队员将来到东湖海洋乐园，和游客朋友一起迎兔年。据悉，节日期间来东湖海洋乐园寻找它们的身影，可领取“宇宙护卫队”专属礼品。参加现场“飞跃宇宙”活动，根据投掷骰子点数，增加探险里程，有机会赢取游玩大礼包。

　　1月22日前，武汉东湖海洋乐园官方微信公众号发布线上活动预告，可参与互动，并有机会赢取游玩门票，成为“天外来兔”宇航员。

　　1月22日至1月26日，“天外来兔”嘻哈闹新春舞台，有专业DJ、MC喊麦助阵，还有本地知名rapper说唱闹新春，可爱兔女郎跳动全场，嘻哈闹新春舞台每日两场。同时，飞鸟世界科普互动大升级，除了鹈鹕大科普外，新增了水豚、鹤鸵、鸵鸟等动物。

　　（文图：赵筱尘 巫邓炎）